1：Vyměňte experimentální zásoby včas

Nastavte (NTC) negativní kontrolu a opakujte to mnohokrát.Jakmile se v laboratoři zjistí, že došlo ke kontaminaci produktu PCR, vyměňte včas všechny experimentální zásoby.Jako například: znovu nařeďte a připravte primery, znovu sterilizujte špičku pipety, EP zkumavku, ddH2O atd., vyměňte pipetu za novou a dočasně si zapůjčte jiné laboratoře k provádění PCR experimentů.Kontaminovaná laboratoř musí být před pokračováním v experimentu větrána a ozařována ultrafialovými paprsky, dokud není kontaminace PCR produktem odstraněna.

2: Prodlužte dobu expozice UV záření

Stojí za zmínku, že k odstranění kontaminace DNA by mělo být pravidelné ultrafialové záření prodlouženo o 2 hodiny než obvykle.I tak ale vliv UV záření na odstranění malých fragmentů (pod 200bp) kontaminace DNA stále není dobrý.

Ultrafialová vlnová délka (nm) je obecně 254/300 nm a stačí ozařovat 30 minut.Je třeba poznamenat, že při volbě UV pro eliminaci kontaminace reziduálních produktů PCR by se měla vzít v úvahu délka produktu PCR a distribuce bází v sekvenci produktu.UV záření je účinné pouze pro dlouhé fragmenty nad 500 bp a má malý vliv na krátké fragmenty.

Během UV ozařování budou pyrimidinové báze v produktu PCR tvořit dimery.Tyto dimery mohou ukončit prodloužení, ale ne všechny pyrimidiny v řetězci DNA mohou tvořit dimery a UV záření může také dimery rozbít..Stupeň tvorby dimeru závisí na vlnové délce UV záření, typu pyrimidinového dimeru a sekvenci nukleotidů sousedících s místem dimeru.Pokud jsou proto amplifikované fragmenty PCR malé, doporučuje se použít systém kontaminace produktu UNG anti-PCR.

3：Běžně používané lapače znečištění DNA

Aerosoly se snadno vytvářejí, když se přidávají pipety, čemuž je obtížné se vyhnout a rychle se usadí.Proto je nepochybně dobrou volbou často používat speciální lapače znečištění DNA, aby se zabránilo šíření znečištění DNA.

4：Použijte systém proti znečištění UNG

Po odstranění kontaminace PCR produktem může testovací laboratoř použít systém kontaminace UNG anti-PCR produktem, aby se zabránilo kontaminaci produktu PCR.V obecných laboratořích můžete provádět jednoduché experimentální rozdělování, striktně oddělovat oblast produktu PCR od ostatních oblastí, stanovit určitá laboratorní pravidla a předpisy a provádět příslušné školení, abyste zabránili výskytu kontaminace produktu PCR.

Doporučení: Zřízení přiměřené laboratoře PCR, udržování dobrého prostředí PCR, formulování standardních pracovních postupů PCR a kultivace přísného provozního povědomí experimentátorů jsou klíčem k prevenci nebo snížení znečištění experimentů PCR.